После исключения из ЕГР вы должны были списать кредиторскую задолженность на внереализационные доходы и уплатить налог на прибыль. Незнание не освобождает от ответственности, перед составлением бухотчетности делаются акты сверки и списки исключенных из ЕГР печатаются в журналах.