Не надо только в том случае, если у ИП земельный участок под магазином меньше 0,5 га и других земельных участков нет. Если общая площадь всех земельных участков у ИП больше 0,5 га, то надо платить ему земельный налог по всей своей земле. На ЧУП обязанность по уплате земельного налога при аренду у ИП не переходит. Не путайте с налогом на недвижимость.