Делаете акт инвентаризации БСО на дату перерегистрации ИП в УП и пишете заявление в налоговую примерно такого плана: в связи с реорганизацией ИП...в УП... прошу зарегистрировать остаток неиспользованых БСО....(перечень с номерами) на ИП... Эту заяву несете своему налоговому инспектору, а она уже будет знать, че с ней дальше делать.