Если Вы юр.лицо - можете выбирать для себя любой метод, прописываете в учетке. Если ИП-ник - только по оплате. Хотя, момент для исчисления НДС ИП-ники могут для себя выбирать самостоятельно - по оплате, либо по отгрузке, но в течение года уже не меняете. Удачи!