2 варианта 1) выпишите задним числом (датой акта). И переделайте пару инвентаризаций БСО. 2) составьте доп соглашение к договору задним числом, о том что СФ по НДС выписывается в течение 2 мес. со дня закрытия работ. Если просто сейчас выписать СФ, то Заказчик не имеет прва взять в зачет этот НДС (чит.Инструкцию).