Никогда такого не было. Если из 16в отнимаете 16в предыдущей и получаете сумму с минусом - ее и пишите. Так они увидят, что они «как бы вам должны». Если поставить ноль, то в следующем месяце у вас в карточке будет сумма, меньшая к уплате, чем в декларации, а в налоговой этого не увидят.