Не правильно делали авансовые отчеты. Сотрудник ехал в командировку 1 и возвращался 2-го числа, затем 2-го выезжал в новую командировку и возвращался 5-го числа. Авансовый составляли на 2-ве командировки 5-го числа, а не каждую по отдельности. Какова ответственность за это нарушение?
Нельзя выдавать аванс на командировочные без отчета по предыдущей (п.34 Инструкции от 28.06.2004 № 98, ч.2 п.33 Инструкции от 29.03.2011 № 107) - нарушение порядка ведения кассовых операций (ст.11.7 КоАП).
Если у Вас есть СПС КонсультантПлюс, то про 2 командировки в 1 день почитайте журнал «Главная книга.by» № 10 за 2011 год «Две командировки в один день. Как возмещать суточные?» (автор И.Жуковская)